标准化运算测试中的实际计算速度排名来看，意义并不很大。当然世界上运算最快的计算机仍然是位于美国田纳西州橡树岭国家实验室的美洲虎超级计算机。它的运算速度在去年11月是1.75千万亿次（浮点运算）。美国在制造超级计算机方面仍然是占统治地位的国家，是在计算机500强中拥有最多台超级计算机的国家。
当然，由于梦想的形态有所不同，对于这个速度的表现也不尽相同。但是，运行神经网络这类智能ai，正好刚刚合适。
由梦想控制的这个网络系统，完全可以对小到原子结构的进行分析，大到宇宙起源进行模拟，都需要高性能计算机。但是，高性能计算机的应用绝不仅限于此，眼下在和大众生活息息相关的各个领域，高性能计算机都在大显身手。
比如，在石油地质勘探中，为了准确勘定钻井井位，需要收集、研究海量的三维地震资料数据。一般而言，对100平方公里的数据进行分析计算，需要使用每秒10亿次运算速度的计算机运算60天。
如果研制一种新药，从化合物筛选到临床试验，一般需要10年到15年的时间。在化合物筛选阶段，对于数十万种化合物，用传统的实验手段，筛选出有效的化合物不仅费时费力，还往往难以得到最佳的结果。而使用计算机模拟手段，就可以在较短的时间内从几十万甚至几百万种化合物中筛选出有效的药物化合物，大大缩短了药物研发的周期。
根据梦想组成的神经网络，按一定的原则对运算资源进行智能管理，所以运行效率很高。
王石在完成了对原子动力模拟软件的校验后，就开始了对最简单的细胞进行模拟，添加不同的化学成分和蛋白酶，观察虚拟细胞的活动情况，了解细胞的反应机理，并详细记录细胞的活动过程，包括通过基因链制造蛋白质的全过程。基因是一串一维的有编码的序列，这个用来编码的东西就是特定的核苷酸，这个核苷酸有个特性，就是在特定的条件下，能与对应的核苷酸连接起来，而且是只能是对应的核苷酸。而蛋白质是怎么制造的呢？基因链是一个条状结构。它上面对应的基因序列，也就是特定的核苷酸序列都会吸引固定一个外界游离的特定核苷酸。然后这些特定的核苷酸连接起来，通过折叠，成为一个蛋白质。
打个简单的比方，比如说，基因序列也就是核苷酸串就象是一串磁性念珠，将磁性念珠放到一个放满散装磁性念珠的箱子里，搅拌一下，然后拿出来。你可以想象会发生什么事情。只是打个比方，你可以将吸附上来的这部分念珠串联起来，实际上，由于核苷酸的构造，它们自己会自动串联起来的。很显然，这部分核苷酸序列与基因有着对应关系。这串核苷酸序列会特定条件下脱落下来，这串长链会在某些蛋白酶的控制下进行折叠组合，一个蛋白质分子就这样生成了。
这个程序最后被王石命名为“微观世界模拟程序”。在这个程序里，王石可以完成从无到有，从简单原子到复杂生命的全过程构建，在这个世界里，王石就是上帝。
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